Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms