Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms