Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms