Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrc5C3VPR6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms