Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms