Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms