Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf3B2RUQ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms