Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms