Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem235B1AQL3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem235B1AQL3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms