Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms