Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms