Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms