Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms