Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam43bA2AM80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms