Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc183A2AJB1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc183A2AJB1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc183A2AJB1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms