Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms