Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms