Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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