Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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