Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms