Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms