Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms