Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtmr1Q9Z2C4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr1Q9Z2C4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms