Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms