Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RfxankQ9Z205 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RfxankQ9Z205 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RfxankQ9Z205 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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