Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp12aQ9Z1W8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp12aQ9Z1W8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms