Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms