Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Padi4Q9Z183 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Padi4Q9Z183 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms