Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog1Q9Z160 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms