Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sh3bp5Q9Z131 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp5Q9Z131 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp5Q9Z131 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp5Q9Z131 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms