Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms