Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms