Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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