Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cib1Q9Z0F4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms