Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Carm1Q9WVG6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carm1Q9WVG6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms