Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms