Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms