Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb3Q9R1P1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms