Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms