Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms