Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NumbQ9QZS3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumbQ9QZS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms