Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms