Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Six6Q9QZ28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Six6Q9QZ28 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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