Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms