Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf11Q9QYK7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms