Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms