Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms