Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fscn3Q9QXW4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fscn3Q9QXW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms