Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms