Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms